RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 HAPLN2Q9GZV7 340 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 RSAD1Q9HA92 442 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 IL23AQ9NPF7 189 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM161AQ9NX61 479 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 TAB2Q9NYJ8 693 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 CNTN3Q9P232 1028 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 PARP2Q9UGN5 583 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 USP20Q9Y2K6 914 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 IPPQ9Y573 584 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-213ENST00000589475 TTC3P53804 2025 aa5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 TET1Q8NFU7 2136 aa5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 INPPL1O15357 1258 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 MGEA5O60502 916 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 AMHP03971 560 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 KCNE1P15382 129 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 CYP3A5P20815 502 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 PAX3P23760 479 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 CDC25BP30305 580 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 TNFSF9P41273 254 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 KCNJ6P48051 423 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 FMO5P49326 533 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF75DP51815 510 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 OSTNP61366 133 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM189BP81408 668 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 UBXN1Q04323 297 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 GRIK3Q13003 919 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 BIRC3Q13489 604 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 LAPTM4AQ15012 233 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 EXOC3L4Q17RC7 722 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ZACNQ401N2 412 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 XKR4Q5GH76 650 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 MIIPQ5JXC2 388 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 GLB1LQ6UWU2 654 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 DEFB128Q7Z7B8 93 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ABI1Q8IZP0 508 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 CEP120Q8N960 986 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 URGCPQ8TCY9 931 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 TAF4BQ92750 862 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 DPF3Q92784 378 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 CCDC127Q96BQ5 260 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ERGIC2Q96RQ1 377 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 NUP58Q9BVL2 599 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 APOL6Q9BWW8 343 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 VPS16Q9H269 839 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 TMX1Q9H3N1 280 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 PDE11AQ9HCR9 933 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 INTS13Q9NVM9 706 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 SNTG2Q9NY99 539 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 IFNKQ9P0W0 207 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 KANSL3Q9P2N6 904 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ITGA11Q9UKX5 1188 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 UMODL1Q5DID0 1318 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ITIH6Q6UXX5 1313 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ALPK3Q96L96 1907 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 SCN5AQ14524 2016 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ARHGEF37A1IGU5 675 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 LACTBL1A8MY62 500 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ENPP3O14638 875 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 PHACTR2O75167 634 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ADCY5O95622 1261 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 FGBP02675 491 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 THP07101 528 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 TRIM49P0CI25 452 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 TRIM49CP0CI26 452 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 P4HA1P13674 534 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 CSF2RAP15509 400 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 ATICP31939 592 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 PNPLA4P41247 253 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 PIK3CAP42336 1068 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 GCLMP48507 274 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 TRPC3Q13507 836 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 GPNMBQ14956 572 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 NR1I3Q14994 352 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-213ENST00000589475 AGERQ15109 404 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms