RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP63Q96MT8 703 aa35.78■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGA11Q9UKX5 1188 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIRO00625 290 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNNC2P02585 160 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTSAP10619 480 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENPEPQ07075 957 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIGD5Q53EQ6 642 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT13P13646 458 aa35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 BFSP1Q12934 665 aa35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCN1AP35498 2009 aa35.76■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CHST7Q9NS84 486 aa35.76■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PLPP4Q5VZY2 271 aa35.75■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 BORCS6Q96GS4 357 aa35.75■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DLG4P78352 724 aa35.74■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM171A1Q5VUB5 890 aa35.74■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa35.74■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXorf38Q8TB03 319 aa35.74■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 VWA8A3KMH1 1905 aa35.73■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF516Q92618 1163 aa35.73■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SUSD3Q96L08 255 aa35.73■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa35.73■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa35.73■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TTPALQ9BTX7 342 aa35.73■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TAF6P49848 677 aa35.72■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBP5P82980 135 aa35.72■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPN14Q15678 1187 aa35.72■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MICALL1Q8N3F8 863 aa35.72■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC52Q8N7C0 313 aa35.72■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf220Q5T0J3 134 aa35.71■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GALT6Q96L58 329 aa35.71■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SYN3O14994 580 aa35.7■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CA8P35219 290 aa35.7■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTP2Q5QGT7 225 aa35.7■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AUTS2Q8WXX7 1259 aa35.7■■■■□ 3.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNA14O95837 355 aa35.69■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SV2CQ496J9 727 aa35.69■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0QZQ0 153 aa35.68■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2CD2LO14523 706 aa35.68■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPTLC1O15269 473 aa35.68■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 LILRB3O75022 631 aa35.68■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM49P0CI25 452 aa35.68■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM49CP0CI26 452 aa35.68■■■■□ 3.3
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