RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 F8W810 466 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 LINC01565O15544 149 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 TRAPPC3O43617 180 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 PPP1R37O75864 691 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 B3GAT3O94766 335 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 KIF4AO95239 1232 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 KCNE1P15382 129 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 GLUD2P49448 558 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CLCNKBP51801 687 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 PSMD2Q13200 908 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ADAM15Q13444 863 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CLUL1Q15846 466 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 DUSP6Q16828 381 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CD302Q8IX05 232 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 EFHBQ8N7U6 833 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 BEST2Q8NFU1 509 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 SAAL1Q96ER3 474 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 HINFPQ9BQA5 517 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 STRA6Q9BX79 667 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.45□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 TTC26A0AVF1 554 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 PODXLO00592 558 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 MBTPS2O43462 519 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 KIF20AO95235 890 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 IL18RAPO95256 599 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ADH1AP07327 375 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 SDHBP21912 280 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 GARTP22102 1010 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 MCM4P33991 863 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CREMQ03060 361 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 PTPN14Q15678 1187 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 NAB2Q15742 525 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 XKR4Q5GH76 650 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 JADE1Q6IE81 842 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 GPD1LQ8N335 351 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CASP10Q92851 521 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 B3GALT6Q96L58 329 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ASB7Q9H672 318 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CD207Q9UJ71 328 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 UBE4BO95155 1302 aa8.44□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ZNF233A6NK53 670 aa8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CLIC2O15247 247 aa8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 KLRC4O43908 158 aa8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 EXTL3O43909 919 aa8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 KINO60870 393 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 SMC2O95347 1197 aa8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 PRR29P0C7W0 189 aa8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 ADSSP30520 456 aa8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 BRCC3P46736 316 aa8.43□□□□□ -1.06
SMG6-211ENST00000572369 CYP2J2P51589 502 aa8.43□□□□□ -1.06
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