RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.44■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 PDXDC1Q6P996 788 aa23.44■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.44■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 SPATA20Q8TB22 786 aa23.44■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 SUSD3Q96L08 255 aa23.44■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.44■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 PIRO00625 290 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 PDXKO00764 312 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 PPEF2O14830 753 aa23.43■■□□□ 1.34
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NME3-210ENST00000567271 C9orf57Q5W0N0 161 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.43■■□□□ 1.34
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NME3-210ENST00000567271 RMND1Q9NWS8 449 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 DPP3Q9NY33 737 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 VWA8A3KMH1 1905 aa23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 ANO9A1A5B4 782 aa23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 SYN3O14994 580 aa23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 SMC2O95347 1197 aa23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 PSMD5Q16401 504 aa23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 SYCE2Q6PIF2 218 aa23.42■■□□□ 1.34
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NME3-210ENST00000567271 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.42■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 M0QZQ0 153 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 MBTPS2O43462 519 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 C1RP00736 705 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
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NME3-210ENST00000567271 SURF1Q15526 300 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.41■■□□□ 1.34
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NME3-210ENST00000567271 S1PR5Q9H228 398 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 DZANK1Q9NVP4 752 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 DMAC2Q9NW81 257 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 MTRRQ9UBK8 725 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.41■■□□□ 1.34
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NME3-210ENST00000567271 IL9P15248 144 aa23.4■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 PAX3P23760 479 aa23.4■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 LILRA4P59901 499 aa23.4■■□□□ 1.34
NME3-210ENST00000567271 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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NME3-210ENST00000567271 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.4■■□□□ 1.34
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NME3-210ENST00000567271 APPL2Q8NEU8 664 aa23.39■■□□□ 1.33
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NME3-210ENST00000567271 ADAM12O43184 909 aa23.38■■□□□ 1.33
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NME3-210ENST00000567271 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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NME3-210ENST00000567271 CXorf38Q8TB03 319 aa23.38■■□□□ 1.33
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NME3-210ENST00000567271 APOL5Q9BWW9 433 aa23.38■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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NME3-210ENST00000567271 H7C4K7 107 aa23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 TBC1D4O60343 1298 aa23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 SPATA31D3P0C874 917 aa23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 OR1D2P34982 312 aa23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 WDR49Q8IV35 697 aa23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.37■■□□□ 1.33
NME3-210ENST00000567271 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.37■■□□□ 1.33
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