RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 SGCZQ96LD1 299 aa5.91□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 CITED4Q96RK1 184 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 SDF4Q9BRK5 362 aa5.91□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 RANBP1P43487 201 aa5.9□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 RNF112Q9ULX5 631 aa5.9□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 JAG2Q9Y219 1238 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.9□□□□□ -1.46
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