RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 KIF22Q14807 665 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PSMD6Q15008 389 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZPBP2Q6X784 338 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 DPP9Q86TI2 863 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PPTC7Q8NI37 304 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 FAM76AQ8TAV0 307 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SEMA4DQ92854 862 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CCDC102AQ96A19 550 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MAML3Q96JK9 1138 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GORASP1Q9BQQ3 440 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SYT11Q9BT88 431 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 A0A0B4J269 797 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MGRN1O60291 552 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RNF8O76064 485 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 LGALS2P05162 132 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 EDN1P05305 212 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CTAGE8P0CG41 777 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NAT1P18440 290 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 KLRC1P26715 233 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RANBP1P43487 201 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 IRAK1P51617 712 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CLDN10P78369 228 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CUL3Q13618 768 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 WDR93Q6P2C0 686 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CCDC80Q76M96 950 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SV2AQ7L0J3 742 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RNF149Q8NC42 400 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 P3H4Q92791 437 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 FNBP1Q96RU3 617 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RAB20Q9NX57 234 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 INTUQ9ULD6 942 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SNX12Q9UMY4 172 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GRIN2DO15399 1336 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MSCO60682 206 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SRGAP2O75044 1071 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PRKCBP05771 671 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 H2AFZP0C0S5 128 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PRLRP16471 622 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ACOT2P49753 483 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MFAP3P55082 362 aa8.3□□□□□ -1.08
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