RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 WNT7BP56706 349 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 STK4Q13043 487 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 LILRA6Q6PI73 481 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 BEST2Q8NFU1 509 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 SUSD3Q96L08 255 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 SFXN1Q9H9B4 322 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 EXOC1Q9NV70 894 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 MTRRQ9UBK8 725 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC189-211ENST00000545825 PPEF2O14830 753 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 SYN3O14994 580 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 SPATA31D3P0C874 917 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 CES5AQ6NT32 575 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 GJD3Q8N144 294 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 GPD1LQ8N335 351 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 RPN1P04843 607 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 WEE2P0C1S8 567 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 DPYDQ12882 1025 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 PSMD2Q13200 908 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 TMC5Q6UXY8 1006 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 DPP7Q9UHL4 492 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 BDP1A6H8Y1 2624 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 ANO9A1A5B4 782 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 PIRO00625 290 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 M0QZQ0 153 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 OR1D2P34982 312 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 RAB33AQ14088 237 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 GPR149Q86SP6 731 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 KREMEN2Q8NCW0 462 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 RIPOR3Q96MK2 946 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 DPP3Q9NY33 737 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 TBC1D4O60343 1298 aa24.35■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 MTHFRP42898 656 aa24.35■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 LILRA4P59901 499 aa24.35■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.35■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 POMKQ9H5K3 350 aa24.35■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.35■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 NCOR1O75376 2440 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF233A6NK53 670 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 LOC730098B7Z3J9 87 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 CLIC2O15247 247 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 SPTLC1O15269 473 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 RFPL2O75678 378 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 RHOBTB3O94955 611 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 PAPLNO95428 1278 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 APPL2Q8NEU8 664 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.33■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 H7C4K7 107 aa24.33■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 CYP2J2P51589 502 aa24.33■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 FAM84AQ96KN4 292 aa24.33■■□□□ 1.49
CCDC189-211ENST00000545825 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms