RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 PARVGQ9HBI0 331 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNH3Q9ULD8 1083 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CA14Q9ULX7 337 aa12.88□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 TISP43B9A030 160 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 H0YCG3 227 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PPEF2O14830 753 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 XYLBO75191 536 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MOSPD3O75425 235 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 OAZ2O95190 189 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 RHOP08100 348 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CYP3A5P20815 502 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 NBL1P41271 181 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CCR2P41597 374 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 GUCY2FP51841 1108 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 DTWD2Q8NBA8 298 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 BEST2Q8NFU1 509 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CLIC6Q96NY7 704 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 RTP3Q9BQQ7 232 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 BACH2Q9BYV9 841 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 FBXL21Q9UKT6 434 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 POLIQ9UNA4 740 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 STYXL1Q9Y6J8 313 aa12.87□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SHISA7A6NL88 538 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 H7C4K7 107 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SPTLC1O15269 473 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 OGTO15294 1046 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PPP1R37O75864 691 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 GLULP15104 373 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PTPN2P17706 415 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SCP2P22307 547 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 STARD6P59095 220 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CTXN3Q4LDR2 81 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SPATA1Q5VX52 437 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 TPGS2Q68CL5 300 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ASCL5Q7RTU5 278 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF720Q7Z2F6 126 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MAP4K3Q8IVH8 894 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJC19Q96DA6 116 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 TCEAL4Q96EI5 215 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 KIF12Q96FN5 646 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CRISPLD1Q9H336 500 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D17Q9HA65 648 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CEP72Q9P209 647 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MTMR6Q9Y217 621 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CFAP54Q96N23 3096 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 COL4A3Q01955 1670 aa12.86□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A087X0B3 334 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MYMKA6NI61 221 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PIRO00625 290 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MICAL2O94851 1124 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM13AO94988 1023 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 FCARP24071 287 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ADSSP30520 456 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MCM4P33991 863 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 LIG4P49917 911 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ARPP19P56211 112 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 TANGO2Q6ICL3 276 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 APPL2Q8NEU8 664 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ING5Q8WYH8 240 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MCRS1Q96EZ8 462 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 BORCS6Q96GS4 357 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ZSWIM3Q96MP5 696 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPAN18Q96SJ8 248 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC3Q9BY71 257 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CYP4F11Q9HBI6 524 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ARHGEF3Q9NR81 526 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 INSL5Q9Y5Q6 135 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MYH15Q9Y2K3 1946 aa12.85□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa12.84□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ANO9A1A5B4 782 aa12.84□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 K7ENM7 598 aa12.84□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 GFRA3O60609 400 aa12.84□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRN2O75325 713 aa12.84□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 CEBPBP17676 345 aa12.84□□□□□ -0.35
CLSTN3-211ENST00000541667 PDCP20941 246 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms