RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	POLD4	Q9HCU8	107 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LAMA1	P25391	3075 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	MYL4	P12829	197 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	EPHA5	P54756	1037 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CCIN	Q13939	588 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF197	O14709	1029 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	DEXI	O95424	95 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CTH	P32929	405 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	TWF1	Q12792	350 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	PON2	Q15165	354 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CEP120	Q8N960	986 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CHFR	Q96EP1	664 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	ACKR2	O00590	384 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	N4BP3	O15049	544 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CHAD	O15335	359 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	LIG1	P18858	919 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	ELF1	P32519	619 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	HSPA4	P34932	840 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	TNK2	Q07912	1038 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	GATA6	Q92908	595 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	LOXL4	Q96JB6	756 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	RING1	Q06587	406 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	FOXC1	Q12948	553 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC32	Q14392	662 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PRU2	124 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	DCLK1	O15075	740 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	MARCH6	O60337	910 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	MPL	P40238	635 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	STK3	Q13188	491 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	NR5A1	Q13285	461 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-222	ENST00000533557	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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