RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528475.1

GSDMD-208, Transcript of gasdermin D, human

TSL 2

Gene GSDMD, Length 2,067 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GSDMD-208	ENST00000528475	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	PARP14	Q460N5	1801 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CFAP73	A6NFT4	308 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	LIG4	P49917	911 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	NOMO3	P69849	1222 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	WLS	Q5T9L3	541 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	FAM228A	Q86W67	206 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	FAM212A	Q96EL1	285 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		24.87	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	POTEJ	P0CG39	1038 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	PIK3CA	P42336	1068 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	RPAIN	Q86UA6	219 aa		24.86	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	PIGR	P01833	764 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CREB1	P16220	341 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	TAS2R40	P59535	323 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	MAMLD1	Q13495	774 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CUL2	Q13617	745 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	STAT4	Q14765	748 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	ZNF365	Q70YC5	407 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	NIM1K	Q8IY84	436 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CDH16	O75309	829 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	VNN1	O95497	513 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	ABHD2	P08910	425 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	TNNI1	P19237	187 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	DSG3	P32926	999 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	PRKCE	Q02156	737 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	LRRC14	Q15048	493 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CCDC63	Q8NA47	563 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	EURL	Q9NYK6	297 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		24.85	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475		O00370	1275 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	SUN1	O94901	812 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	BRAF	P15056	766 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	KLRC2	P26717	231 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	MTMR2	Q13614	643 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CDHR1	Q96JP9	859 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CCDC77	Q9BR77	488 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	RIPK3	Q9Y572	518 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	RGS20	O76081	388 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	LMNB2	Q03252	620 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	GALNTL6	Q49A17	601 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	ATG4C	Q96DT6	458 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	FAM84A	Q96KN4	292 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		24.84	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	WNT7B	P56706	349 aa		24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	STRN3	Q13033	797 aa		24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	RIPK1	Q13546	671 aa		24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	TNFAIP1	Q13829	316 aa		24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	XKR3	Q5GH77	459 aa		24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	MGARP	Q8TDB4	240 aa		24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		24.83	■■□□□ 1.57
GSDMD-208	ENST00000528475	SI	P14410	1827 aa		24.83	■■□□□ 1.56
GSDMD-208	ENST00000528475	GJB6	O95452	261 aa		24.82	■■□□□ 1.56
GSDMD-208	ENST00000528475	GNA15	P30679	374 aa		24.82	■■□□□ 1.56
GSDMD-208	ENST00000528475	SLC8A1	P32418	973 aa		24.82	■■□□□ 1.56
GSDMD-208	ENST00000528475	OAZ1	P54368	228 aa		24.82	■■□□□ 1.56
GSDMD-208	ENST00000528475	ACTR2	P61160	394 aa		24.82	■■□□□ 1.56
GSDMD-208	ENST00000528475	CXCL9	Q07325	125 aa		24.82	■■□□□ 1.56
GSDMD-208	ENST00000528475	C2CD6	Q53TS8	623 aa		24.82	■■□□□ 1.56
GSDMD-208	ENST00000528475	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		24.82	■■□□□ 1.56
GSDMD-208	ENST00000528475	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56

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