RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519028.1

TNFRSF10B-204, Transcript of TNF receptor superfamily member 10b, humanhuman

TSL 2

Gene TNFRSF10B, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10B-204ENST00000519028 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.13■■□□□ 1.13
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TNFRSF10B-204ENST00000519028 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 SUSD3Q96L08 255 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 GBP4Q96PP9 640 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ASB2Q96Q27 587 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 FNIP2Q9P278 1114 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.13■■□□□ 1.13
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TNFRSF10B-204ENST00000519028 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 EXOC3O60645 756 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
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TNFRSF10B-204ENST00000519028 MYBPC2Q14324 1141 aa22.12■■□□□ 1.13
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TNFRSF10B-204ENST00000519028 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 M0QZQ0 153 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 NR3C1P04150 777 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 MCM4P33991 863 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CLCN4P51793 760 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 LILRA4P59901 499 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PSMD6Q15008 389 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CAMK4Q16566 473 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 NFIL3Q16649 462 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 AAK1Q2M2I8 961 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ISM2Q6H9L7 571 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CXorf38Q8TB03 319 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 FAM84AQ96KN4 292 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 INTS13Q9NVM9 706 aa22.11■■□□□ 1.13
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TNFRSF10B-204ENST00000519028 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.1■■□□□ 1.13
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TNFRSF10B-204ENST00000519028 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.1■■□□□ 1.13
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TNFRSF10B-204ENST00000519028 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 WDR49Q8IV35 697 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CASP10Q92851 521 aa22.09■■□□□ 1.13
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TNFRSF10B-204ENST00000519028 SIX4Q9UIU6 781 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CD207Q9UJ71 328 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ADAM12O43184 909 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TBC1D4O60343 1298 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10B-204ENST00000519028 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.07■■□□□ 1.12
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