RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ADCY1Q08828 1119 aa28.76■■■□□ 2.2
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SH3BP2-221ENST00000511747 RASA4BC9J798 803 aa28.72■■■□□ 2.19
SH3BP2-221ENST00000511747 RASA4O43374 803 aa28.72■■■□□ 2.19
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SH3BP2-221ENST00000511747 MAGEA4P43358 317 aa28.72■■■□□ 2.19
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