RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASB7Q9H672 318 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDH7Q9ULB5 785 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNH3Q9ULD8 1083 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DERAQ9Y315 318 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIP11Q15643 1979 aa16.46■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYMKA6NI61 221 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANHXE9PGG2 379 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 M0QZQ0 153 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRRG1O14668 218 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLCN5P51795 746 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPAG1Q07617 926 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA1Q5VX52 437 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADALQ6DHV7 355 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF280DQ6N043 979 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SFR1Q86XK3 245 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSCBQ8IWL3 235 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BEST2Q8NFU1 509 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WNT16Q9UBV4 365 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPTLC2O15270 562 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP6R2O75170 966 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R37O75864 691 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OAZ2O95190 189 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARPP19P56211 112 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ALCAMQ13740 583 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RSAD2Q8WXG1 361 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM212AQ96EL1 285 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STRA6Q9BX79 667 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PANK2Q9BZ23 570 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CITO14578 2027 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VWA8A3KMH1 1905 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR27A2RRH5 827 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YEATS4O95619 227 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRG1P02750 347 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRFP11831 508 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IDEP14735 1019 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTPN2P17706 415 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACOT2P49753 483 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NTHL1P78549 312 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HTR4Q13639 388 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 JADE1Q6IE81 842 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTSS1LQ765P7 747 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP37Q86T82 979 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRSS33Q8NF86 280 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGF13Q92913 245 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACCSQ96QU6 501 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CUEDC2Q9H467 287 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP4F11Q9HBI6 524 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C2CD2Q9Y426 696 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TYMPP19971 482 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LILRA4P59901 499 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PANK4Q9NVE7 773 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GDE1Q9NZC3 331 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIEZO1Q92508 2521 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A087X0B3 334 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR6C75A6NL08 312 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NARSO43776 548 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CUTAO60888 179 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL18RAPO95256 599 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GCNT3O95395 438 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RHOP08100 348 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADSSP30520 456 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AMPD3Q01432 767 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCF15Q12870 199 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATL3Q6DD88 541 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms