RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493315.1

WDPCP-217, Transcript of WD repeat containing planar cell polarity effector, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDPCP, Length 1,476 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCP-217ENST00000493315 WDR49Q8IV35 697 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MMS19Q96T76 1030 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PSMB7Q99436 277 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ARID3AQ99856 593 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SYT11Q9BT88 431 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TLR10Q9BXR5 811 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ANK1P16157 1881 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.33□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ADAM23O75077 832 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 KIF4AO95239 1232 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TNNC2P02585 160 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CXCR5P32302 372 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 RGS2P41220 211 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TNFSF9P41273 254 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 INHBEP58166 350 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 BPIFB4P59827 614 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 C2orf54Q08AI8 447 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SREBF2Q12772 1141 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TRPC3Q13507 836 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 IRF5Q13568 498 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NCOA4Q13772 614 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 GRIK4Q16099 956 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SEZ6Q53EL9 994 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF677Q86XU0 584 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NLRP7Q8WX94 980 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PBKQ96KB5 322 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 EPC1Q9H2F5 836 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 FZD8Q9H461 694 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 AMFRQ9UKV5 643 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PTPRJQ12913 1337 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MGAMO43451 1857 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 A0A087WZ62 844 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CCDC151A5D8V7 595 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CES2O00748 559 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ERLIN2O94905 339 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 IL18RAPO95256 599 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 VNN1O95497 513 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 VTNP04004 478 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 GJB1P08034 283 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MMEP08473 750 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CLTAP09496 248 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 GZMAP12544 262 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CYP11B1P15538 503 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 GPC5P78333 572 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 FMO1Q01740 532 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CDR2Q01850 454 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ITIH3Q06033 890 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CUL2Q13617 745 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 KYAT1Q16773 422 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 FAM187BQ17R55 369 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF410Q86VK4 478 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CREG2Q8IUH2 290 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 COG1Q8WTW3 980 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.32□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms