RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	GBP4	Q96PP9	640 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	FSD2	A1L4K1	749 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	TEX28	O15482	410 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	NR3C1	P04150	777 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	NDUFV1	P49821	464 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	ISM2	Q6H9L7	571 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	SUSD3	Q96L08	255 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	FNIP2	Q9P278	1114 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	EXOC3	O60645	756 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	KLRC2	P26717	231 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	MCM4	P33991	863 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	27.92	■■■□□ 2.06	2e-6	■■■■□ 23.3
TTC3-223	ENST00000492275	CYP24A1	Q07973	514 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	ASB2	Q96Q27	587 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	PTPRJ	Q12913	1337 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	EPCAM	P16422	314 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	KCNQ1	P51787	676 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	MYBPC2	Q14324	1141 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	PSMD6	Q15008	389 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	SURF1	Q15526	300 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CAMK4	Q16566	473 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CXorf38	Q8TB03	319 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	SPTLC1	O15269	473 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	BMP6	P22004	513 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CASP4	P49662	377 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CLCN4	P51793	760 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	LILRA4	P59901	499 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	PSMD5	Q16401	504 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	NFIL3	Q16649	462 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	INTS13	Q9NVM9	706 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275		M0QZQ0	153 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	SYN3	O14994	580 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CLUL1	Q15846	466 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	AAK1	Q2M2I8	961 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	ADSSL1	Q8N142	457 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CASP10	Q92851	521 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC3-223	ENST00000492275	ADAM12	O43184	909 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	ADH1A	P07327	375 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	MORC3	Q14149	939 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CENPP	Q6IPU0	288 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	PDXDC1	Q6P996	788 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	WDR49	Q8IV35	697 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	BORCS6	Q96GS4	357 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	MTRR	Q9UBK8	725 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	BIN1	O00499	593 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	ITGB3	P05106	788 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	BMP1	P13497	986 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	NR2F2	P24468	414 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CREM	Q03060	361 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	PALB2	Q86YC2	1186 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF516	Q92618	1163 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	SIX4	Q9UIU6	781 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CD207	Q9UJ71	328 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	TBC1D4	O60343	1298 aa		27.86	■■■□□ 2.05

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