RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487791.1

HBA1-204, Transcript of hemoglobin subunit alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HBA1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1-204ENST00000487791 CETN1Q12798 172 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 GPR65Q8IYL9 337 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 APPL2Q8NEU8 664 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 MARCH5Q9NX47 278 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.77■■□□□ 1.56
HBA1-204ENST00000487791 ANO9A1A5B4 782 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 PIRO00625 290 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 GRM6O15303 877 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 CLSTN1O94985 981 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 IGFBP4P22692 258 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 CA8P35219 290 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 SPRED2Q7Z698 418 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 RABGGTAQ92696 567 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 TCF25Q9BQ70 676 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 DSEQ9UL01 958 aa24.76■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 SYN3O14994 580 aa24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 GLUD2P49448 558 aa24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 HASPINQ8TF76 798 aa24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 SMTNL1A8MU46 457 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 TPM2P07951 284 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 CTSAP10619 480 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 ODC1P11926 461 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 ATICP31939 592 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 WNT7BP56706 349 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 LILRA4P59901 499 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 KRT39Q6A163 491 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 Q7L0L9 218 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 TTPALQ9BTX7 342 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 TMEM8AQ9HCN3 771 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 EPOPA6NHQ4 379 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 RFXAPO00287 272 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 CXCL14O95715 111 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 P4HA1P13674 534 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 FOSL2P15408 326 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 GUCY2FP51841 1108 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 MYL5Q02045 173 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 METTL23Q86XA0 190 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 CEP57Q86XR8 500 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 TAF4BQ92750 862 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 HPDLQ96IR7 371 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 SUSD3Q96L08 255 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.73■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 BECN2A8MW95 431 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 KPNA7A9QM74 516 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 H7C4K7 107 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 MXI1P50539 228 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 TPM4P67936 248 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 ZACNQ401N2 412 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 BORCS6Q96GS4 357 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 ZBP1Q9H171 429 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 IRAK3Q9Y616 596 aa24.72■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 NCK2O43639 380 aa24.71■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 HUS1O60921 280 aa24.71■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 TRIM49P0CI25 452 aa24.71■■□□□ 1.55
HBA1-204ENST00000487791 TRIM49CP0CI26 452 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms