RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC191Q8NCU4 936 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 IL17DQ8TAD2 202 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF503Q96F45 646 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 KAZALD1Q96I82 304 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NCDNQ9UBB6 729 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ATP10DQ9P241 1426 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 BCORQ6W2J9 1755 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD62A6NC57 917 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF202O95125 648 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NTSR2O95665 410 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 IGHDP01880 384 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GNAI2P04899 355 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SERPINB2P05120 415 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GNAI3P08754 354 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 MMP10P09238 476 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 C1SP09871 688 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 TM4SF1P30408 202 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 DGCR2P98153 550 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GAGE13Q4V321 117 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SDE2Q6IQ49 451 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC14AQ86T13 490 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 FERMT2Q96AC1 680 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ARL8AQ96BM9 186 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GPHA2Q96T91 129 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 FEZ1Q99689 392 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 TCF25Q9BQ70 676 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ZMAT4Q9H898 229 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 IL23AQ9NPF7 189 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SCN7AQ01118 1682 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PXDNLA1KZ92 1463 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2QL1A1L167 161 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 OPHN1O60890 802 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PCDH8O95206 1070 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-211ENST00000484135 PARP10Q53GL7 1025 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-211ENST00000484135 CEP85Q6P2H3 762 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SKAP1Q86WV1 359 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 AHI1Q8N157 1196 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD44Q8N8A2 993 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC136Q96JN2 1154 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 UIMC1Q96RL1 719 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 HAPLN2Q9GZV7 340 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PLAAQ9Y263 795 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC12Q96J65 1359 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 UTYO14607 1347 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0A6YYJ9 748 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 FSBPO95073 299 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SCNN1BP51168 640 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 IL2P60568 153 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM8P78325 824 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ATP8B2P98198 1209 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 OCRLQ01968 901 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC32Q14392 662 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CNBD1Q8NA66 436 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 MIEF2Q96C03 454 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 MFSD3Q96ES6 412 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 MTFR1LQ9H019 292 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SIL1Q9H173 461 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GREM2Q9H772 168 aa5.78□□□□□ -1.48
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