RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484022.1

GNL3-209, Transcript of G protein nucleolar 3, human

TSL 2

Gene GNL3, Length 668 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNL3-209	ENST00000484022	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TTC14	Q96N46	770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022		Q9Y3F1	56 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ACACB	O00763	2458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	PTPRF	P10586	1907 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TRANK1	O15050	2925 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ORC4	O43929	436 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	NUAK1	O60285	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ZEB2	O60315	1214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	CABYR	O75952	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	PGK2	P07205	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MX1	P20591	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	BCL6	P41182	706 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MC3R	P41968	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	KCNJ6	P48051	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	LIMS1	P48059	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TFAP4	Q01664	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TLE2	Q04725	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	RBL2	Q08999	1139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TESK1	Q15569	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	BAD	Q92934	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	EPN3	Q9H201	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	DMD	P11532	3685 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	C22orf46	C9J442	243 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	HIP1	O00291	1037 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	FGA	P02671	866 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ASGR2	P07307	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	CLTB	P09497	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	MCC	P23508	829 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	FPR2	P25090	351 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	PML	P29590	882 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-209	ENST00000484022	NBL1	P41271	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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