RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 PSMD6Q15008 389 aa7.59□□□□□ -1.19
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SHQ1-207ENST00000475558 DRP2Q13474 957 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 SYCP1Q15431 976 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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SHQ1-207ENST00000475558 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.57□□□□□ -1.2
SHQ1-207ENST00000475558 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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