RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466352.5

PRKCZ-206, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-206	ENST00000466352	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	KCNA5	P22460	613 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	LRPAP1	P30533	357 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	BRCC3	P46736	316 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352		I3L4J1	428 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TBX10	O75333	385 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	BMP6	P22004	513 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	FGFR3	P22607	806 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	STIM1	Q13586	685 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	BECN2	A8MW95	431 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	PDXK	O00764	312 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	PPEF2	O14830	753 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	IKBKB	O14920	756 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TEX28	O15482	410 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	KIF20A	O95235	890 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	CYP2J2	P51589	502 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	KCNQ1	P51787	676 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	PIR	O00625	290 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	EPCAM	P16422	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	KLRC2	P26717	231 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	NDUFV1	P49821	464 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	CLCN4	P51793	760 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TPM4	P67936	248 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	IQCB1	Q15051	598 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	RNF214	Q8ND24	703 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRKCZ-206	ENST00000466352	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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