RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 SUSD3Q96L08 255 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CORO1BQ9BR76 489 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 REEP2Q9BRK0 252 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 GDE1Q9NZC3 331 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KCND2Q9NZV8 630 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 R4GN57 208 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 NOTCH4Q99466 2003 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP250Q9BV73 2442 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ATF2P15336 505 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 NCKAP1LP55160 1127 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TPGS2Q68CL5 300 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ADSSL1Q8N142 457 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX12PQ92771 950 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF12Q96FN5 646 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CALML4Q96GE6 196 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 AK8Q96MA6 479 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 INSL5Q9Y5Q6 135 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TTC26A0AVF1 554 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 LACTBL1A8MY62 500 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 H0YCG3 227 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 K7ENM7 598 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ECI2O75521 394 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM13AO94988 1023 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CPB1P15086 417 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PLCG1P19174 1290 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CD72P21854 359 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFSF9P41273 254 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 LIG4P49917 911 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 GUCY2FP51841 1108 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PFKPQ01813 784 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 GRIN1Q05586 938 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ADCY1Q08828 1119 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MCM6Q14566 821 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TANGO2Q6ICL3 276 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MYCT1Q8N699 235 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TBX20Q9UMR3 447 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CITO14578 2027 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 COL4A3Q01955 1670 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM170BA6NMN3 283 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 M0QZQ0 153 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PPEF2O14830 753 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC26A4O43511 780 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM189A1O60320 539 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 SP9P0CG40 484 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MYL4P12829 197 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 LRPAP1P30533 357 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CCR2P41597 374 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MCM2P49736 904 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PRKCQQ04759 706 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TWF1Q12792 350 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 GRM2Q14416 872 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KARSQ15046 597 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KYAT1Q16773 422 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 USP37Q86T82 979 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ELMOD1Q8N336 334 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 RAD54LQ92698 747 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM212AQ96EL1 285 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MSTO1Q9BUK6 570 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 BCO2Q9BYV7 579 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms