RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 H0YCG3 227 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 LAMTOR5O43504 91 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 RFPL2O75678 378 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PTPN2P17706 415 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 WEE1P30291 646 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 GRM5P41594 1212 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CYP4A11Q02928 519 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 LMNB2Q03252 620 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 KANK3Q6NY19 840 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PALB2Q86YC2 1186 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ELMOD1Q8N336 334 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ZFP42Q96MM3 310 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 EPC1Q9H2F5 836 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CA14Q9ULX7 337 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 VWA8A3KMH1 1905 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PTGESO14684 152 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ABLIM3O94929 683 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 LARGE1O95461 756 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 MCF2P10911 925 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 KCNE1P15382 129 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ATP2B1P20020 1258 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CNR2P34972 360 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 LONRF3Q496Y0 759 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 RTP2Q5QGT7 225 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 OXER1Q8TDS5 423 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 FGF13Q92913 245 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 AIFM3Q96NN9 605 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 KCND2Q9NZV8 630 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SOBPA7XYQ1 873 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 MYO1CO00159 1063 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 RECQL4O94761 1208 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 KIF4AO95239 1232 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CTDNEP1O95476 244 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 OR52Z1P0C646 297 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SYT1P21579 422 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 TXKP42681 527 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ELF2Q15723 593 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PADI6Q6TGC4 694 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 APPL2Q8NEU8 664 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 DRC1Q96MC2 740 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 RTKNQ9BST9 563 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 APOL6Q9BWW8 343 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 COL4A2P08572 1712 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 F13A1P00488 732 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 LRG1P02750 347 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 AKAP5P24588 427 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CASQ1P31415 396 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ELF1P32519 619 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PRPHP41219 470 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 EPHA5P54756 1037 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 UPP1Q16831 310 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 IRF7Q92985 503 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms