RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TKTP29401 623 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MCM4P33991 863 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLUL1Q15846 466 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TJAP1Q5JTD0 557 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPFIBP1Q86W92 1011 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CASP10Q92851 521 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMARCE1Q969G3 411 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DPP3Q9NY33 737 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FNIP2Q9P278 1114 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADH1AP07327 375 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EPCAMP16422 314 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLCN4P51793 760 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CREMQ03060 361 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSMD5Q16401 504 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C9orf57Q5W0N0 161 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RDH13Q8NBN7 331 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SUSD3Q96L08 255 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CD207Q9UJ71 328 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCN1AP35498 2009 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANO9A1A5B4 782 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PIRO00625 290 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPL17P18621 184 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKRD54Q6NXT1 300 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PDXDC1Q6P996 788 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SYN3O14994 580 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EXOC3O60645 756 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BMP1P13497 986 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SURF1Q15526 300 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC9A9Q8IVB4 645 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GLYCTKQ8IVS8 523 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM174Q8WUU8 243 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DMAC2Q9NW81 257 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CALUO43852 315 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM84AQ96KN4 292 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLSTN3Q9BQT9 956 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 M0QZQ0 153 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MBTPS2O43462 519 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NR3C1P04150 777 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LILRA4P59901 499 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYP24A1Q07973 514 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SYCE2Q6PIF2 218 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKS3Q6ZW76 656 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMRP1Q8NCR6 262 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MTRRQ9UBK8 725 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCDHB8Q9UN66 801 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTPRJQ12913 1337 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRXCR2A6NFK2 248 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GLUD1P00367 558 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM191BP0C7N4 346 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IL9P15248 144 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSMD6Q15008 389 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DSTYKQ6XUX3 929 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PALB2Q86YC2 1186 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MTMR12Q9C0I1 747 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INTS13Q9NVM9 706 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DZANK1Q9NVP4 752 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TSC2P49815 1807 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A0C4DFX4 3053 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPTLC1O15269 473 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ITGB3P05106 788 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRCPP42785 496 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYBPC2Q14324 1141 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COBLL1Q53SF7 1204 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WDR49Q8IV35 697 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 APPL2Q8NEU8 664 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR5B17Q8NGF7 314 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MFSD14AQ96MC6 490 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GBP4Q96PP9 640 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAM12O43184 909 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TGM5O43548 720 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C1RP00736 705 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PAX3P23760 479 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TAF6P49848 677 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NFIL3Q16649 462 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC127Q96BQ5 260 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-202ENST00000440016 APOL5Q9BWW9 433 aa29.31■■■□□ 2.28
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