RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 TNRQ92752 1358 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 PRAMEF4O60810 478 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 FSBPO95073 299 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 LY86O95711 162 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 LDHCP07864 332 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 ANTXR2P58335 489 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 TLE1Q04724 770 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 RPTNQ6XPR3 784 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 DTX3Q8N9I9 347 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 NAXEQ8NCW5 288 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 SNX33Q8WV41 574 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 ALG3Q92685 438 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 PPM1MQ96MI6 270 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 RMDN3Q96TC7 470 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 STK33Q9BYT3 514 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 SERHLQ9NQF3 203 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 DNAI1Q9UI46 699 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 PRRG2O14669 202 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 NCAM2O15394 837 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 TNFAIP3P21580 790 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 MAPKAPK2P49137 400 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 PRKG1Q13976 671 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 ZACNQ401N2 412 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 HYIQ5T013 277 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 Q6ZVL8 140 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 IFI44Q8TCB0 444 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 LRFN1Q9P244 771 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 ABCA6Q8N139 1617 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 A0A1B0GVC2 190 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 J3KRW8 73 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 PYGLP06737 847 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 SDHBP21912 280 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 GLDCP23378 1020 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 GLRBP48167 497 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 UBE3CQ15386 1083 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 PFKFB4Q16877 469 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 MST1LQ2TV78 715 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 MUL1Q969V5 352 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 STK32BQ9NY57 414 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 COL20A1Q9P218 1284 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 PDP2Q9P2J9 529 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 A2MP01023 1474 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 RHOBTB3O94955 611 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 FGFR2P21802 821 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 ARL4CP56559 192 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 BEND5Q7L4P6 421 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-212ENST00000434424 IQCDQ96DY2 449 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms