RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430889.2

HOXC4-202, Transcript of homeobox C4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC4, Length 1,666 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4-202ENST00000430889 EPHX2P34913 555 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 SLC1A1P43005 524 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 MAPK6Q16659 721 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 TMEM270Q6UE05 265 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 SLCO2A1Q92959 643 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 DPH5Q9H2P9 285 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 LRRC19Q9H756 370 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC4-202ENST00000430889 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ACKR2O00590 384 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 HBP1O60381 514 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 C22orf31O95567 290 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 GNA15P30679 374 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 FNTAP49354 379 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ARHGAP1Q07960 439 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MTMR3Q13615 1198 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 SURF1Q15526 300 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ASB14A6NK59 587 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 B4GALT4O60513 344 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 PROSCO94903 275 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF844Q08AG5 666 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MAMLD1Q13495 774 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ZBTB33Q86T24 672 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 PODXLO00592 558 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MYL6P60660 151 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 POU5F1BQ06416 359 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 SNAPC2Q13487 334 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 TTLL4Q14679 1199 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 FAM187BQ17R55 369 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ARMCX2Q7L311 632 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 FMO2Q99518 471 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 SYT17Q9BSW7 474 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 KATNBL1Q9H079 304 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 EFCC1Q9HA90 598 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MYO1FO00160 1098 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ASAP2O43150 1006 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 GJB1P08034 283 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MMP8P22894 467 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 GBP1P32455 592 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MAN1A1P33908 653 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 IRAK1P51617 712 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 TFDP1Q14186 410 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC4-202ENST00000430889 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms