RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 GINS2Q9Y248 185 aa14.54□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 SKIP12755 728 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.54□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.54□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 MAGEB18Q96M61 343 aa14.54□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 STOML1Q9UBI4 398 aa14.54□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 CYP3A7P24462 503 aa14.53□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.53□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.53□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.53□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.53□□□□□ -0.08
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.53□□□□□ -0.08
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SGMS1-203ENST00000429490 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.52□□□□□ -0.089e-7■■□□□ 13.8
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SGMS1-203ENST00000429490 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.52□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 GPD1LQ8N335 351 aa14.52□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 FBXO41Q8TF61 875 aa14.52□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.52□□□□□ -0.09
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SGMS1-203ENST00000429490 PSMD10O75832 226 aa14.52□□□□□ -0.09
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