RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 METRNLQ641Q3 311 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TMPRSS6Q8IU80 811 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FITM2Q8N6M3 262 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 IL17DQ8TAD2 202 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 BRD9Q9H8M2 597 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 JKAMPQ9P055 326 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CPA4Q9UI42 421 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PCDHA6Q9UN73 950 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TPP1O14773 563 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 RECQL4O94761 1208 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FGL2Q14314 439 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GALEQ14376 348 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 ZNF365Q70YC5 407 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GDF7Q7Z4P5 450 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TEX101Q9BY14 249 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CAPN8A6NHC0 703 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 AHRRA9YTQ3 701 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 MATN4O95460 622 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GJB1P08034 283 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CKBP12277 381 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GCSHP23434 173 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GNALP38405 381 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TBX4P57082 545 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CCDC181Q5TID7 509 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TMIEQ8NEW7 156 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 ZSWIM1Q9BR11 485 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CEP72Q9P209 647 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 L1RE1Q9UN81 338 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CFAP69A5D8W1 941 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 ZNF785A8K8V0 405 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 DIRC3C9JPN6 131 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TRIM24O15164 1050 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PRC1O43663 620 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 RPS6KA4O75676 772 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 C1SP09871 688 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 KITP10721 976 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 HDCP19113 662 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SOX8P57073 446 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FAM189BP81408 668 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SLFN5Q08AF3 891 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 KIF22Q14807 665 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SPRED1Q7Z699 444 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GPR20Q99678 358 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TLR10Q9BXR5 811 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 RSAD1Q9HA92 442 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.35□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms