RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF185O15231 689 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK17Q00537 523 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SPP2Q13103 211 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PDIA5Q14554 519 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PPCSQ9HAB8 311 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 NPHS2Q9NP85 383 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MRGBPQ9NV56 204 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR35Q9P2L0 1181 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 HMOX2P30519 316 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLL6Q8N841 843 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF560Q96MR9 790 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 STXBP3O00186 592 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 AP3B1O00203 1094 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR47O94967 919 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP10P09238 476 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 LSP1P33241 339 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CARSP49589 748 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 HLFQ16534 295 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 AGAP3Q96P47 875 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 STK33Q9BYT3 514 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNN4O15554 427 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 AKAP10O43572 662 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ADCY3O60266 1144 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 FDX1P10109 184 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SRGNP10124 158 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 EFNA5P52803 228 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXW4P57775 412 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SKOR1P84550 965 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLL4Q14679 1199 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEAQ6S8J7 498 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ADSSL1Q8N142 457 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC4FQ8N1N0 589 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 THTPAQ9BU02 230 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PJA2O43164 708 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PDGFRAP16234 1089 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB9P50453 376 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT72Q14CN4 511 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MS4A14Q96JA4 679 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ENO4A6NNW6 628 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM66O15016 1216 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF2O75151 1096 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 UCHL3P15374 230 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNA3P22001 575 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 S100A5P33763 92 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CCZ1BP86790 482 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 P3H1Q32P28 736 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ACCSLQ4AC99 568 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 APEX2Q9UBZ4 518 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 B2RBV5 119 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL3P08590 195 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 IRAK1P51617 712 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RUNX1T1Q06455 604 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 LONRF1Q17RB8 773 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 DEPDC1Q5TB30 811 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MFN1Q8IWA4 741 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF21AQ96BD5 680 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 OTULINQ96BN8 352 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF12Q96FN5 646 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MASTLQ96GX5 879 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms