RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CES5AQ6NT32 575 aa27.11■■□□□ 1.93
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HTATSF1-202ENST00000425695 GPD1LQ8N335 351 aa27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1-202ENST00000425695 FEZF2Q8TBJ5 459 aa27.11■■□□□ 1.93
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HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC34Q96HJ3 373 aa27.05■■□□□ 1.92
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HTATSF1-202ENST00000425695 C19orf67A6NJJ6 358 aa27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 H7C4K7 107 aa27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 SPTLC1O15269 473 aa27.04■■□□□ 1.92
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HTATSF1-202ENST00000425695 CTXN3Q4LDR2 81 aa27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR149Q86SP6 731 aa27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 NT5DC4Q86YG4 428 aa27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 XXYLT1Q8NBI6 393 aa27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 POMKQ9H5K3 350 aa27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1586Q9HCI6 787 aa27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa27.04■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 M0QZQ0 153 aa27.03■■□□□ 1.92
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