RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.22■□□□□ 0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PAX3P23760 479 aa18.21■□□□□ 0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C16orf59Q7L2K0 433 aa18.21■□□□□ 0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 FMNL3Q8IVF7 1028 aa18.21■□□□□ 0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HPDLQ96IR7 371 aa18.21■□□□□ 0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 STK33Q9BYT3 514 aa18.21■□□□□ 0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FHOD1Q9Y613 1164 aa18.21■□□□□ 0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT9P35527 623 aa18.2■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF365Q70YC5 407 aa18.2■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.2■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF19Q8IW93 802 aa18.2■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SPAG5Q96R06 1193 aa18.2■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DGKIO75912 1065 aa18.19■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RRAGAQ7L523 313 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TC2NQ8N9U0 490 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR8K1Q8NGG5 319 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TATDN2Q93075 761 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 PANX2Q96RD6 677 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC7Q99615 494 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 PODXLO00592 558 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPP2O95045 317 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAF6P49848 677 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADKP55263 362 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 JAM2P57087 298 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPP1Q16831 310 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 SV2CQ496J9 727 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPOPLQ6IQ16 392 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDXDC1Q6P996 788 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC43Q8N309 656 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 HERVK_113Q902F9 699 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.53e-6■□□□□ 10.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABHD10Q9NUJ1 306 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC53A6NM62 1247 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBBXA8MT70 800 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAT1P42224 750 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLCNKBP51801 687 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPHB4P54760 987 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNNC1P63316 161 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB103AP81534 67 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM130Q8N3G9 435 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.17■□□□□ 0.5
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