RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409406.1

RBM4-205, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RBM4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-205	ENST00000409406	PAK2	Q13177	524 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ASIC2	Q16515	512 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	IFT20	Q8IY31	132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	FZD8	Q9H461	694 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	NFU1	Q9UMS0	254 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406		F8VZ95	297 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	MAGEB2	O15479	319 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ASAP2	O43150	1006 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PRKCI	P41743	596 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PTEN	P60484	403 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	CAP1	Q01518	475 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ENPEP	Q07075	957 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	MAPK6	Q16659	721 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	KRT39	Q6A163	491 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406		A0A087X0T9	212 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PRKCB	P05771	671 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	FAM228B	P0C875	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PSMD6	Q15008	389 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	HTT	P42858	3142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	CLDN3	O15551	220 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	B4GALT5	O43286	388 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ATP2C2	O75185	946 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TOM1L1	O75674	476 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TOMM70	O94826	608 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	GTF2H1	P32780	548 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	CETN1	Q12798	172 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TFDP1	Q14186	410 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	SPA17	Q15506	151 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	GRIK4	Q16099	956 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PSMB7	Q99436	277 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	EBF2	Q9HAK2	575 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ANK1	P16157	1881 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	ACKR2	O00590	384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	AOC2	O75106	756 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	MOCS3	O95396	460 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	F2	P00734	622 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	GLI1	P08151	1106 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	GHR	P10912	638 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PROZ	P22891	400 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	CXCR5	P32302	372 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	SOX5	P35711	763 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	PAFAH1B1	P43034	410 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM4-205	ENST00000409406	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms