RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM47CQ5HY64 1035 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF720Q7Z2F6 126 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP4F11Q9HBI6 524 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA8CPA6NN73 597 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 C17orf75Q9HAS0 396 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB6BQ9NRW1 208 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PSTPIP1O43586 416 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TAC1P20366 129 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR72Q3MJ13 1102 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CATSPER4Q7RTX7 472 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 FGD4Q96M96 766 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ENO1P06733 434 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 OCRLQ01968 901 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PTK7Q13308 1070 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEB18Q96M61 343 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 NUDT12Q9BQG2 462 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SEMA4AQ9H3S1 761 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 STAP1Q9ULZ2 295 aa17.25■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 OATP04181 439 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 APRTP07741 180 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RFX8Q6ZV50 586 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC35C1Q96A29 364 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 WRNIP1Q96S55 665 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 HAUS8Q9BT25 410 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 UNC45AQ9H3U1 944 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ATRNO75882 1429 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 IFT172Q9UG01 1749 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNN4O15554 427 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP11B1P15538 503 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MIIPQ5JXC2 388 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 METTL23Q86XA0 190 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ICA1LQ8NDH6 482 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ATG4AQ8WYN0 398 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PI4K2AQ9BTU6 479 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TBX20Q9UMR3 447 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CHMP2BQ9UQN3 213 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 NR3C2P08235 984 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RCCD1A6NED2 376 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 EXTL3O43909 919 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CST8O60676 142 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RBP3P10745 1247 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PAMP19021 973 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINB9P50453 376 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 NT5DC3Q86UY8 548 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CD302Q8IX05 232 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ACAP3Q96P50 834 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFATQ9P243 1243 aa17.24■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 STX3Q13277 289 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TTMPQ5BVD1 217 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PPIL6Q8IXY8 311 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MREGQ8N565 214 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM143Q96AN5 459 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 EHD4Q9H223 541 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 YY1AP1Q9H869 796 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP17.23■□□□□ 0.352e-15■■□□□ 12.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MAFGO15525 162 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 FSBPO95073 299 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ABL1P00519 1130 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM67Q6ZTA4 783 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RASSF3Q86WH2 238 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAAF5Q86Y56 855 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF149Q8NC42 400 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CBWD1Q9BRT8 395 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PHTF1Q9UMS5 762 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKCBP05771 671 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 CRYMQ14894 314 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MTMR9Q96QG7 549 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SH3GL3Q99963 347 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MYBL2P10244 700 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PDGFRAP16234 1089 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM151AQ8WW52 585 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PGM2Q96G03 612 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 MANSC1Q9H8J5 431 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM51Q9NW97 253 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PAK5Q9P286 719 aa17.23■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 STAT5BP51692 787 aa17.22■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMC6P62333 389 aa17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms