RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 VNN1O95497 513 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 VIMP08670 466 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 RALAP11233 206 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 DSG3P32926 999 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 CCNG2Q16589 344 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 SPOPLQ6IQ16 392 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 KATNAL2Q8IYT4 538 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 SCINQ9Y6U3 715 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 PIGRP01833 764 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ACOT2P49753 483 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 WNT7BP56706 349 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 NOMO3P69849 1222 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 JDP2Q8WYK2 163 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf70Q9BRQ4 267 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 LDHAP00338 332 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 EGFRP00533 1210 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 C2CD6Q53TS8 623 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 SCYL3Q8IZE3 742 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 NEU2Q9Y3R4 380 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 TCEA3O75764 348 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 GNA15P30679 374 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 DCAF15Q66K64 600 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF280CQ8ND82 737 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 THAP12O43422 761 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 IFNAR2P48551 515 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 PTPRJQ12913 1337 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 MAMLD1Q13495 774 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CHADLQ6NUI6 762 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM270Q6UE05 265 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF365Q70YC5 407 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC89Q8N998 374 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 EXD1Q8NHP7 514 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 HEMGNQ9BXL5 484 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 OSBPL8Q9BZF1 889 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CYP39A1Q9NYL5 469 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 NAMPTP43490 491 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 DEPTORQ8TB45 409 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 DYDC1Q8WWB3 177 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CNTN6Q9UQ52 1028 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CLTAP09496 248 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 TAS2R40P59535 323 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 KYNUQ16719 465 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 PASD1Q8IV76 773 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CGRRF1Q99675 332 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 PORCNQ9H237 461 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ACAD9Q9H845 621 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 NINJ2Q9NZG7 142 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 K7ERI5 159 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ATP2C2O75185 946 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 XRCC4Q13426 336 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM143Q96AN5 459 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 C12orf42Q96LP6 360 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 HAPLN2Q9GZV7 340 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 GSTA1P08263 222 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CFHP08603 1231 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CETN2P41208 172 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ASAP3Q8TDY4 903 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 MAF1Q9H063 256 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM120BA0PK00 339 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ATP2A1O14983 1001 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 GLRA2P23416 452 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 CEP128Q6ZU80 1094 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 FUKQ8N0W3 1084 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 MSTO1Q9BUK6 570 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 MTFR1LQ9H019 292 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF302Q9NR11 478 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 PICK1Q9NRD5 415 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 HAUS2Q9NVX0 235 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 LCTP09848 1927 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD13-201ENST00000392539 LRRIQ4A6NIV6 560 aa28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms