RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRJQ12913 1337 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ACOT2P49753 483 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 AUHQ13825 339 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMD6Q15008 389 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ACAD10Q6JQN1 1059 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 CHST13Q8NET6 341 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 MAF1Q9H063 256 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC12A4Q9UP95 1085 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SIP14410 1827 aa25.46■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa25.46■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 MGRN1O60291 552 aa25.46■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.46■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 UVRAGQ9P2Y5 699 aa25.46■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SPOPO43791 374 aa25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 RARAP10276 462 aa25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 VGLL4Q14135 290 aa25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ZACNQ401N2 412 aa25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 CHADLQ6NUI6 762 aa25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 C1orf112Q9NSG2 853 aa25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 BTBD7Q9P203 1132 aa25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 EDN1P05305 212 aa25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 SLCO1A2P46721 670 aa25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 STRN3Q13033 797 aa25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 LBX2Q6XYB7 198 aa25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM228AQ86W67 206 aa25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA1586Q9HCI6 787 aa25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.45■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 ECEL1O95672 775 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 HLA-DRAP01903 254 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 TNNI1P19237 187 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL2P36404 184 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 RWDD2BP57060 319 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 CALCOCO2Q13137 446 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 CNGA2Q16280 664 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 SLCO2A1Q92959 643 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 PCYT2Q99447 389 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC19Q9H756 370 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 VNN1O95497 513 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 UNGP13051 313 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 ABCD1P33897 745 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 NEDD9Q14511 834 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 GPATCH11Q8N954 259 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNN1Q92952 543 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 FNBP1Q96RU3 617 aa25.44■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 VIMP08670 466 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 NAMPTP43490 491 aa25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 PIGRP01833 764 aa25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 DEPTORQ8TB45 409 aa25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 WHRNQ9P202 907 aa25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNG1Q9UIX4 513 aa25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 MCM8Q9UJA3 840 aa25.43■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.42■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 K7ERI5 159 aa25.42■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC8A1P32418 973 aa25.42■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa25.42■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNJ1P48048 391 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP1R7Q15435 360 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 EXOC3L1Q86VI1 746 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 SCLT1Q96NL6 688 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 PLVAPQ9BX97 442 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM7Q9C029 511 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 CXorf56Q9H5V9 222 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 PIK3CAP42336 1068 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR44Q5JSH3 913 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC25Q86WR0 208 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 MCOLN2Q8IZK6 566 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 GPC2Q8N158 579 aa25.41■■□□□ 1.66
AMIGO1-201ENST00000369862 CPA5Q8WXQ8 436 aa25.41■■□□□ 1.66
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