RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 GCNT1Q02742 428 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 GPNMBQ14956 572 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB6Q15916 424 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 SV2CQ496J9 727 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 HS1BP3Q53T59 392 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 GJB7Q6PEY0 223 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 NPAS4Q8IUM7 802 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 HELQQ8TDG4 1101 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 ABHD8Q96I13 439 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 HPDLQ96IR7 371 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 ZFP42Q96MM3 310 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 DEF6Q9H4E7 631 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-201ENST00000368202 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 PTGESO14684 152 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 ASS1P00966 412 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 POMCP01189 267 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 KRT5P13647 590 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 FERP16591 822 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 KCNJ6P48051 423 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 GUCY2FP51841 1108 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 ARID5BQ14865 1188 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 WDR72Q3MJ13 1102 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 NOMO2Q5JPE7 1267 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 SPOPLQ6IQ16 392 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 TMTC1Q8IUR5 882 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC52Q8N7C0 313 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 RSPH1Q8WYR4 309 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 BAP1Q92560 729 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 DPF3Q92784 378 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 TATDN2Q93075 761 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 JAKMIP2Q96AA8 810 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 FAXDC2Q96IV6 333 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 UROC1Q96N76 676 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 MMS19Q96T76 1030 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 DNAJC7Q99615 494 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 DNAI2Q9GZS0 605 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 IL23AQ9NPF7 189 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 RNF19AQ9NV58 838 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 LTBP2Q14767 1821 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 F8VZ95 297 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 LRRN2O75325 713 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 GFPT2O94808 682 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 BAIAP3O94812 1187 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 UPP2O95045 317 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 SKILP12757 684 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 LRPAP1P30533 357 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 SOX5P35711 763 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 TAF6P49848 677 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 ARID5AQ03989 594 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 FPGSQ05932 587 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 KLHL30Q0D2K2 578 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 TUSC3Q13454 348 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 CUL2Q13617 745 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 VPS36Q86VN1 386 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 MIOSQ9NXC5 875 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 SIX4Q9UIU6 781 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 PLAGL2Q9UPG8 496 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 NUB1Q9Y5A7 615 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 ZBBXA8MT70 800 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 FGBP02675 491 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 SERPING1P05155 500 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 FGFR1P11362 822 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 JAM2P57087 298 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 TTC39CQ8N584 583 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 BADQ92934 168 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 AIPL1Q9NZN9 384 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRK-201ENST00000368202 ANO9A1A5B4 782 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms