RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PANK2Q9BZ23 570 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PIDD1Q9HB75 910 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP54Q96N23 3096 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 LACTBL1A8MY62 500 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TISP43B9A030 160 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SYN3O14994 580 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CUTAO60888 179 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ASGR2P07307 311 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 C8AP07357 584 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 IDEP14735 1019 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 MCM4P33991 863 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 KRT85P78386 507 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PKP1Q13835 747 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 RAB33AQ14088 237 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ADALQ6DHV7 355 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SUSD3Q96L08 255 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 H7C4K7 107 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CCL16O15467 120 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 XYLBO75191 536 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GCNT3O95395 438 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ADRB2P07550 413 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CYP3A5P20815 502 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 LRPAP1P30533 357 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA9P31269 272 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ACOT2P49753 483 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GUCY2FP51841 1108 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CASP5P51878 434 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ROR1Q01973 937 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ALCAMQ13740 583 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB6Q15916 424 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 JADE1Q6IE81 842 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF280DQ6N043 979 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 APPL2Q8NEU8 664 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ASIC4Q96FT7 647 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ACCSQ96QU6 501 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 STRA6Q9BX79 667 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TNMDQ9H2S6 317 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CUEDC2Q9H467 287 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PANK4Q9NVE7 773 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 WDR27A2RRH5 827 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 M0QZQ0 153 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PRRG1O14668 218 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NFICP08651 508 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 POU2F2P09086 479 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FSHRP23945 695 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ADSSP30520 456 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ME1P48163 572 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ARPP19P56211 112 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 KCNA1Q09470 495 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 UVSSAQ2YD98 709 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.31□□□□□ -1.08
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