RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PPP6R2O75170 966 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 LRRN2O75325 713 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 WASP42768 502 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GRB10Q13322 594 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 HOOK3Q86VS8 718 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MAB21L3Q8N8X9 362 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SENP8Q96LD8 212 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MAN1C1Q9NR34 630 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3CDO00329 1044 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 KCNA2P16389 499 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ICAM3P32942 547 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GUCY2FP51841 1108 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 UBXN1Q04323 297 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC50Q8IVM0 306 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RAD54LQ92698 747 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TAF4BQ92750 862 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PRIMPOLQ96LW4 560 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CUEDC2Q9H467 287 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 USP25Q9UHP3 1055 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 HPCAL4Q9UM19 191 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MYH8P13535 1937 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3R2O00459 728 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NRP1O14786 923 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS3O15072 1205 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 AP1G2O75843 785 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 IL18RAPO95256 599 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CCNE2O96020 404 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 KRT10P13645 584 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 LCP1P13796 627 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PFKFB1P16118 471 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFA8P51970 172 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SP2Q02086 613 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PAK1Q13153 545 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SHISA4Q96DD7 197 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TTC25Q96NG3 672 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 REEP2Q9BRK0 252 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 STK39Q9UEW8 545 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MEI4A8MW99 385 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 IKBKBO14920 756 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 INPPL1O15357 1258 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 B4GALT5O43286 388 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MED24O75448 989 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RNF8O76064 485 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CMA1P23946 247 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PTENP60484 403 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf27AQ580R0 203 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM270Q6UE05 265 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CD302Q8IX05 232 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 HDDC3Q8N4P3 179 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NELFBQ8WX92 580 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL18Q96ME1 805 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DZANK1Q9NVP4 752 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MAP10Q9P2G4 905 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GTF3C4Q9UKN8 822 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MED7O43513 233 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ASGR2P07307 311 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM200BP0CF97 657 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GJA1P17302 382 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NFKBIAP25963 317 aa4.74□□□□□ -1.65
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