RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 B4GALT3O60512 393 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 CST3P01034 146 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 OR1G1P47890 313 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 NR1I3Q14994 352 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 EXOC3L4Q17RC7 722 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 HCSTQ9UBK5 93 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 ATICP31939 592 aa29.91■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 TMEM130Q8N3G9 435 aa29.91■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 TAF4BQ92750 862 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 PAAF1Q9BRP4 392 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 CRACR2AQ9BSW2 395 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM5Q9C035 493 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 PRO3102Q9H379 93 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 GRPEL1Q9HAV7 217 aa29.9■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 CACNG4Q9UBN1 327 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 FAN1Q9Y2M0 1017 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 BCAR1P56945 870 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 MYL6P60660 151 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 WDR44Q5JSH3 913 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 TEX33O43247 280 aa29.89■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 B3GAT3O94766 335 aa29.89■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 PAX3P23760 479 aa29.89■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 SLC11A1P49279 550 aa29.89■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 EHBP1Q8NDI1 1231 aa29.89■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 SEMA4DQ92854 862 aa29.89■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 HPDLQ96IR7 371 aa29.89■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 ERGIC2Q96RQ1 377 aa29.89■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa29.88■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 NRP1O14786 923 aa29.88■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 PPEF2O14830 753 aa29.88■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF699Q32M78 642 aa29.88■■■□□ 2.37
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNF558Q96NG5 402 aa29.88■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 VRTNQ9H8Y1 702 aa29.88■■■□□ 2.37
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GIPC1-201ENST00000345425 LMO3Q8TAP4 145 aa29.87■■■□□ 2.37
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GIPC1-201ENST00000345425 LILRA4P59901 499 aa29.86■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 NOP14P78316 857 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
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GIPC1-201ENST00000345425 RAB30Q15771 203 aa29.86■■■□□ 2.37
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GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1671Q9BY89 1806 aa29.84■■■□□ 2.37
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GIPC1-201ENST00000345425 TADA2AO75478 443 aa29.84■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 PPM1AP35813 382 aa29.84■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 PBX3P40426 434 aa29.84■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 MRE11P49959 708 aa29.84■■■□□ 2.37
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GIPC1-201ENST00000345425 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa29.83■■■□□ 2.37
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