RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 DZANK1Q9NVP4 752 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 HSPBP1Q9NZL4 362 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 SPDYE4A6NLX3 237 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 PALB2Q86YC2 1186 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 FBXL18Q96ME1 805 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 S1PR5Q9H228 398 aa27.07■■□□□ 1.92
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CXCL2-201ENST00000296031 EFCAB13Q8IY85 973 aa27.06■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
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CXCL2-201ENST00000296031 DPP3Q9NY33 737 aa27.05■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 CUL9Q8IWT3 2517 aa27.05■■□□□ 1.92
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CXCL2-201ENST00000296031 CYP2J2P51589 502 aa27.04■■□□□ 1.92
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CXCL2-201ENST00000296031 CBWD2Q8IUF1 395 aa27.04■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 GOLGA5Q8TBA6 731 aa27.04■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 MAN1C1Q9NR34 630 aa27.04■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 DPP7Q9UHL4 492 aa27.04■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA31D3P0C874 917 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 PNOCQ13519 176 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 C12orf56Q8IXR9 622 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 ADAM7Q9H2U9 754 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 PDE11AQ9HCR9 933 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 MTRRQ9UBK8 725 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 BACE2Q9Y5Z0 518 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 ANO9A1A5B4 782 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 PIRO00625 290 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 ADAM12O43184 909 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 TGM5O43548 720 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
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CXCL2-201ENST00000296031 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
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CXCL2-201ENST00000296031 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL2-201ENST00000296031 XXYLT1Q8NBI6 393 aa27.02■■□□□ 1.92
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CXCL2-201ENST00000296031 PCDHB8Q9UN66 801 aa27.02■■□□□ 1.92
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CXCL2-201ENST00000296031 LILRA4P59901 499 aa27.01■■□□□ 1.91
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CXCL2-201ENST00000296031 APPL2Q8NEU8 664 aa27.01■■□□□ 1.91
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CXCL2-201ENST00000296031 KCTD10Q9H3F6 313 aa27.01■■□□□ 1.91
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CXCL2-201ENST00000296031 PDXKO00764 312 aa27■■□□□ 1.91
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CXCL2-201ENST00000296031 SURF1Q15526 300 aa27■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ADHFE1Q8IWW8 467 aa27■■□□□ 1.91
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CXCL2-201ENST00000296031 RMND1Q9NWS8 449 aa27■■□□□ 1.91
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CXCL2-201ENST00000296031 RAB33AQ14088 237 aa26.99■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 KREMEN2Q8NCW0 462 aa26.99■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.99■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 BDP1A6H8Y1 2624 aa26.99■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 EXOC3O60645 756 aa26.98■■□□□ 1.91
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