RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAPK6Q16659 721 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAF1Q9H063 256 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 LGR5O75473 907 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACCSLQ4AC99 568 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTPRFP10586 1907 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 CD58P19256 250 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF394Q53GI3 561 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRKCBP05771 671 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLCN3P51790 818 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR90Q96KV7 1748 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 MCM3APO60318 1980 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 NCOA4Q13772 614 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 IER5Q5VY09 327 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 SBF1O95248 1867 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 VNN1O95497 513 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRT14P02533 472 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAPK4P31152 587 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 FNTAP49354 379 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNCBQ16143 134 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZIM3Q96PE6 472 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 OPA1O60313 960 aa22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 CUL2Q13617 745 aa22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 CAVIN3Q969G5 261 aa22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 SOCS7O14512 581 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNAPC2Q13487 334 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTLL4Q14679 1199 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCP11Q8WWU5 503 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 THAP12O43422 761 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 TNFRSF8P28908 595 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 GNA15P30679 374 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 EFNA5P52803 228 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLCB4Q15147 1175 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 C3orf20Q8ND61 904 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 FGD4Q96M96 766 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 CGRRF1Q99675 332 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOM1L1O75674 476 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 RRM1P23921 792 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 GJC1P36383 396 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 RANBP1P43487 201 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 BPIFB4P59827 614 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 DR1Q01658 176 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRIK3Q13003 919 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM7Q9C029 511 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEC24CP53992 1094 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRPC3Q13507 836 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1-201ENST00000292211 WHAMMQ8TF30 809 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms