RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 FAM163BP0C2L3 166 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 NMT1P30419 496 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SLC16A2P36021 539 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PSMC6P62333 389 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SUSD4Q5VX71 490 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PCNX4Q63HM2 1172 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 IYDQ6PHW0 289 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TRABD2AQ86V40 505 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CATSPER2Q96P56 530 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MTMR9Q96QG7 549 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 EYA3Q99504 573 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RUSC1Q9BVN2 902 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 OSBPL8Q9BZF1 889 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SAR1AQ9NR31 198 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GRID1Q9ULK0 1009 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PPM1HQ9ULR3 514 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SIGLEC16A6NMB1 481 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 C2CD2LO14523 706 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MAPK4P31152 587 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 FMO5P49326 533 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RASA2Q15283 850 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PRR16Q569H4 304 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CMPK2Q5EBM0 449 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GRAMD4Q6IC98 578 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC8BQ6P9F7 803 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RAPH1Q70E73 1250 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 EFCAB3Q8N7B9 438 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TUBB6Q9BUF5 446 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MANSC1Q9H8J5 431 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SIX2Q9NPC8 291 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 APPL1Q9UKG1 709 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ADCY3O60266 1144 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ECE2O60344 883 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 BANF1O75531 89 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PDE5AO76074 875 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GGPS1O95749 300 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CETN1Q12798 172 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 COG2Q14746 738 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP6NLQ92738 828 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 NCANO14594 1321 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ATP2A1O14983 1001 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 KLC3Q6P597 504 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GCNAQ96QF7 691 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CYP26A1O43174 497 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 STAMBPO95630 424 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 KRT5P13647 590 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF76P36508 570 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CCR3P51677 355 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 IRX4P78413 519 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CBWD6Q4V339 395 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM119Q4V9L6 283 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CBWD3Q5JTY5 395 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CBWD5Q5RIA9 395 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CLEC10AQ8IUN9 316 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC24Q8N4L8 307 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 OR6Y1Q8NGX8 325 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TCP10LQ8TDR4 215 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 HSPBAP1Q96EW2 488 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 BTBD7Q9P203 1132 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 NEU2Q9Y3R4 380 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L15C9J2P7 530 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L13C9JLJ4 530 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L11C9JVI0 530 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L18D6R9N7 530 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L22D6RA61 530 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L17D6RBQ6 530 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L19D6RCP7 530 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L20D6RJB6 530 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MED24O75448 989 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 BGNP21810 368 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GCLMP48507 274 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L24Q0WX57 530 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 IKQ13123 557 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 EPC2Q52LR7 807 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L6PQ6QN14 398 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC89Q8N998 374 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 GSTCDQ8NEC7 633 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ERLEC1Q96DZ1 483 aa12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms