RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHHQ15465 462 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASIC2Q16515 512 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GJB7Q6PEY0 223 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HACE1Q8IYU2 909 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HELQQ8TDG4 1101 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNX27Q96L92 541 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CGRRF1Q99675 332 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GDF15Q99988 308 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RSAD1Q9HA92 442 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EFCAB14O75071 495 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OFD1O75665 1012 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SERPING1P05155 500 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SURF1Q15526 300 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPN14Q15678 1187 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KYAT1Q16773 422 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HGSNATQ68CP4 663 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SV2AQ7L0J3 742 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOP1MTQ969P6 601 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC42Q96M95 316 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK33Q9BYT3 514 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MIOSQ9NXC5 875 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARL5CA6NH57 179 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNNI1P19237 187 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALKAL1Q6UXT8 129 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF516Q92618 1163 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPRJQ12913 1337 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAT1P42224 750 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCNN1GP51170 649 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTGESO14684 152 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POMCP01189 267 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NFICP08651 508 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AP3M2P53677 418 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT83P78385 493 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZACNQ401N2 412 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 JADE1Q6IE81 842 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEMA4DQ92854 862 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DEF6Q9H4E7 631 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAB20Q9NX57 234 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LAMA3Q16787 3333 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIP11Q15643 1979 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TUBB4AP04350 444 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNNT1P13805 278 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FERP16591 822 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RASIP1Q5U651 963 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR49Q8IV35 697 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNTN3Q9P232 1028 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 F8VZ95 297 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCA5LO95447 670 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SOX5P35711 763 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRKCIP41743 596 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GUCY2FP51841 1108 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF11P52732 1056 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 XKR4Q5GH76 650 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms