RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.71□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.71□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 TATDN2Q93075 761 aa11.71□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ASB7Q9H672 318 aa11.71□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 POLIQ9UNA4 740 aa11.71□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 BAIAP3O94812 1187 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 GNA14O95837 355 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 HLA-DRAP01903 254 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 RGS19P49795 217 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 CDH8P55286 799 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 CCDC142Q17RM4 750 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 XKR4Q5GH76 650 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 KRT39Q6A163 491 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 HACE1Q8IYU2 909 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 SPC24Q8NBT2 197 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ACP6Q9NPH0 428 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 A0A1B0GTH6 734 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 LGALS16A8MUM7 142 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 IL18RAPO95256 599 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 SLC11A1P49279 550 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 TPM4P67936 248 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 CLDN10P78369 228 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 TMC2Q8TDI7 906 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 C17orf80Q9BSJ5 609 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 C2CD2Q9Y426 696 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.7□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 PODXLO00592 558 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 NRP1O14786 923 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ADCY5O95622 1261 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 TNNC2P02585 160 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 WEE2P0C1S8 567 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 SKIP12755 728 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 KCNE1P15382 129 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 NR1I3Q14994 352 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 UPP1Q16831 310 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ZNF394Q53GI3 561 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 COLGALT2Q8IYK4 626 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 LMO3Q8TAP4 145 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 PBX4Q9BYU1 374 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 XYLT2Q9H1B5 865 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 CWH43Q9H720 699 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 RAB20Q9NX57 234 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 C2CD2LO14523 706 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 CD58P19256 250 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 PON1P27169 355 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 GRIK3Q13003 919 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 TRPC3Q13507 836 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 RASIP1Q5U651 963 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 TAS1R1Q7RTX1 841 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 CEP57Q86XR8 500 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 URGCPQ8TCY9 931 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 MMS19Q96T76 1030 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.69□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 MAPK13O15264 365 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 LINC00271P0C7V0 271 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 DNAJB2P25686 324 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 LILRA4P59901 499 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 DSC1Q08554 894 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 TUSC3Q13454 348 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 CD300LGQ6UXG3 332 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 LRRC43Q8N309 656 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPA-201ENST00000260116 BEST2Q8NFU1 509 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms