RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 RAG1P15918 1043 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 JAM2P57087 298 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 EPC2Q52LR7 807 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 RUFY4Q6ZNE9 571 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ASIC3Q9UHC3 531 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 A6NNZ2 444 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CUL2Q13617 745 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 TUBB8Q3ZCM7 444 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ALS2CLQ60I27 953 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 PLEKHH3Q7Z736 793 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CREG2Q8IUH2 290 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 BSNDQ8WZ55 320 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 DPH5Q9H2P9 285 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 PASKQ96RG2 1323 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 FKBP1BP68106 108 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 MYO1EQ12965 1108 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 TTC30AQ86WT1 665 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 RARBP10826 455 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ADORA2AP29274 412 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 DR1Q01658 176 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ENPEPQ07075 957 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CROCCP2Q86T23 111 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 C7orf31Q8N865 590 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CARD9Q9H257 536 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SIX2Q9NPC8 291 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 NFU1Q9UMS0 254 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ALG6Q9Y672 507 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ACTN2P35609 894 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 DGKDQ16760 1214 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM50Q86XT4 487 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 WDR49Q8IV35 697 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 TTC39CQ8N584 583 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 FIZ1Q96SL8 496 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 PMM2O15305 246 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CNMDO75829 334 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SLC1A1P43005 524 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SLC8A3P57103 927 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ERICH1Q86X53 443 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 HOMER3Q9NSC5 361 aa11.3□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA0754O94854 1291 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 MMEP08473 750 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CLCN3P51790 818 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 DLK2Q6UY11 383 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 PASD1Q8IV76 773 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC77Q9BR77 488 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ST7Q9NRC1 585 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF394Q53GI3 561 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SGO2Q562F6 1265 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC25Q86WR0 208 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 RNF217Q8TC41 542 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SHC3Q92529 594 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 TATDN2Q93075 761 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 HESX1Q9UBX0 185 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 PODXLO00592 558 aa11.29□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 CLTAP09496 248 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms