RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SMARCE1Q969G3 411 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 ASB2Q96Q27 587 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 CLSTN3Q9BQT9 956 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 RMND1Q9NWS8 449 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 DPP3Q9NY33 737 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 FNIP2Q9P278 1114 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-201ENST00000236273 SPTLC1O15269 473 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 SMC2O95347 1197 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 RPL17P18621 184 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 BMP6P22004 513 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 PRCPP42785 496 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 KCNQ1P51787 676 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CLCN4P51793 760 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CEP57Q86XR8 500 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 SUSD3Q96L08 255 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 C5orf42Q9H799 3197 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 M0QZQ0 153 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 BMP1P13497 986 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 EPCAMP16422 314 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CYP24A1Q07973 514 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 NFIL3Q16649 462 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 LLGL2Q6P1M3 1020 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 EP400NLQ6ZTU2 488 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 BORCS6Q96GS4 357 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 PLXNA3P51805 1871 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 ADAM12O43184 909 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC3O43617 180 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D4O60343 1298 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 NR3C1P04150 777 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CASP4P49662 377 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 NDUFV1P49821 464 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 LILRA4P59901 499 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MYBPC2Q14324 1141 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 PSMD6Q15008 389 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 ISM2Q6H9L7 571 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 LILRA6Q6PI73 481 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 SYCE2Q6PIF2 218 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 INTS13Q9NVM9 706 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 FSD2A1L4K1 749 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 EXOC3O60645 756 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 KIF20AO95235 890 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 KLRC2P26717 231 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD54Q6NXT1 300 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 ADSSL1Q8N142 457 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 ZNF516Q92618 1163 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 S1PR5Q9H228 398 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 SIX4Q9UIU6 781 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 SYN3O14994 580 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MCM4P33991 863 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MORC3Q14149 939 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 SURF1Q15526 300 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CLUL1Q15846 466 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 PSMD5Q16401 504 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CAMK4Q16566 473 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CENPPQ6IPU0 288 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MTRRQ9UBK8 725 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 SMRP1Q8NCR6 262 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 CASP10Q92851 521 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SYF2-201ENST00000236273 GRXCR2A6NFK2 248 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 C1RP00736 705 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ADH1AP07327 375 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CLDN10P78369 228 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 AAK1Q2M2I8 961 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 PALB2Q86YC2 1186 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 WDR49Q8IV35 697 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms