RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPN14Q15678 1187 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 USP41Q3LFD5 358 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 FOXR2Q6PJQ5 311 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CETN3O15182 167 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TNNI1P19237 187 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 GLUD2P49448 558 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CLDN10P78369 228 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 RTP2Q5QGT7 225 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 MLKLQ8NB16 471 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 SIX4Q9UIU6 781 aa23.51■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TSC2P49815 1807 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TRAPPC3O43617 180 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 LILRB3O75022 631 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 ITGB3P05106 788 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 STX17P56962 302 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 DLG4P78352 724 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 DSG1Q02413 1049 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 DUOXA2Q1HG44 320 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF516Q92618 1163 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 BORCS6Q96GS4 357 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 MED15Q96RN5 788 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 ITGA11Q9UKX5 1188 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 BICDL2A1A5D9 508 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CXCL14O95715 111 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 URODP06132 367 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 FGFR3P22607 806 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 NLRP12P59046 1061 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 LILRA4P59901 499 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TMC2Q8TDI7 906 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 SUSD3Q96L08 255 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TTPALQ9BTX7 342 aa23.49■■□□□ 1.35
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SLC25A39-201ENST00000225308 C2CD2LO14523 706 aa23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 SPTLC1O15269 473 aa23.48■■□□□ 1.35
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SLC25A39-201ENST00000225308 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
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SLC25A39-201ENST00000225308 C1orf220Q5T0J3 134 aa23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.48■■□□□ 1.35
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SLC25A39-201ENST00000225308 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 PPM1EQ8WY54 764 aa23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TNNC2P02585 160 aa23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TKTP29401 623 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 HYAL1Q12794 435 aa23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 BFSP1Q12934 665 aa23.48■■□□□ 1.35
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SLC25A39-201ENST00000225308 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CEP57Q86XR8 500 aa23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 GPR65Q8IYL9 337 aa23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.48■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 RWDD2AQ9UIY3 292 aa23.48■■□□□ 1.35
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SLC25A39-201ENST00000225308 A0A0C4DFX4 3053 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 M0QZQ0 153 aa23.47■■□□□ 1.35
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SLC25A39-201ENST00000225308 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CA8P35219 290 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 NRIP1P48552 1158 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 VAMP7P51809 220 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TLE6Q9H808 572 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 AGAP1Q9UPQ3 857 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 PLXNA3P51805 1871 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TAF6P49848 677 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 ENPEPQ07075 957 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 COL19A1Q14993 1142 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CEP63Q96MT8 703 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC25A39-201ENST00000225308 IKBKBO14920 756 aa23.45■■□□□ 1.34
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