RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mad2l2Q9D752 211 aa9.77□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rnf103Q9R1W3 683 aa9.77□□□□□ -0.84
Thbs1-201ENSMUST00000039559 4930444G20RikD3Z741 495 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rap1gds1E9Q912 607 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AF366264G3X9P9 502 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm7942L7N277 499 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 L1camP11627 1260 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmc5Q32NZ6 967 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm7247Q6UY52 187 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zbed4Q80WQ9 1168 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Drd5Q8BLD9 478 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q9D937 123 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pidd1Q9ERV7 915 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc25a13Q9QXX4 676 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm28961A0A087WPA5 222 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm21858A0A087WQ24 222 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ugt1a8D3Z748 530 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ugt1a10E9PXN7 530 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PtpreP49446 699 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rasip1Q3U0S6 961 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zc4h2Q68FG0 224 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fastkd1Q6DI86 829 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rundc3bQ6PDC0 408 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lrrc1Q80VQ1 524 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ttc22Q8C159 568 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nemp2Q8CB65 421 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 LzicQ8K3C3 190 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q9CR55 154 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Frmd7A2AD83 703 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lonrf1D3YY23 762 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm5861F6VCN9 180 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 4933402N22RikF7D1B3 190 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Serpinb9O08797 374 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nol4P60954 483 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Axdnd1Q3UZ57 424 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fbxl5Q8C2S5 690 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 C8aQ8K182 587 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lrrc46Q9DAP0 323 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tbk1Q9WUN2 729 aa9.77□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Abcb11Q9QY30 1321 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mt-CybP00158 381 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Epha2Q03145 977 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zcwpw1Q6IR42 630 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Usp49Q6P9L4 685 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Armc12Q80X86 340 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem145Q8C4U2 746 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hacd3Q8K2C9 362 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SynrgQ5SV85 1306 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm13023A2A8N2 498 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Men1O88559 611 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 C2P21180 760 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 WhammQ571B6 793 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Grid1Q61627 1009 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nudt16Q6P3D0 195 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccnt2Q7TQK0 723 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lrfn2Q80TG9 788 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AarsQ8BGQ7 968 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 BrdtQ91Y44 956 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hars2Q99KK9 505 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Clca1Q9D7Z6 913 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ube4bQ9ES00 1173 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hoxb8P09632 243 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdh2P15116 906 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Xlr3cQ61806 226 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ano4Q8C5H1 955 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kcnq3Q8K3F6 873 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ttc8Q8VD72 515 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CinpQ9D0V8 212 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dgcr8Q9EQM6 773 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Capn7Q9R1S8 813 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kank3Q9Z1P7 791 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm17615E9Q9P2 165 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Serpina1eQ00898 413 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 BegainQ68EF6 600 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Baiap2l2Q80Y61 522 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Agap1Q8BXK8 857 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Reep2Q8VCD6 254 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr397Q8VEZ6 315 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trex1Q91XB0 314 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccdc77Q9CZH8 489 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Uchl3Q9JKB1 230 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfyve16Q80U44 1528 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zmym2Q9CU65 1376 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam205aA2APU8 1308 aa9.76□□□□□ -0.85
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ankrd63A2ARS0 390 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.7 ms