RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 MAP3K13O43283 966 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 NR1I2O75469 434 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 BCKDHBP21953 392 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PRKCEQ02156 737 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 NIPA1Q7RTP0 329 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 EVI5LQ96CN4 794 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 KRT23Q9C075 422 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 YY1AP1Q9H869 796 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 GTSE1Q9NYZ3 720 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 MTRRQ9UBK8 725 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 CACNG4Q9UBN1 327 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 IPPQ9Y573 584 aa12.99□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PTPRBP23467 1997 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 CAPN8A6NHC0 703 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 ATG13O75143 517 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 KRT38O76015 456 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 ITGA4P13612 1032 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 CD59P13987 128 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PTPN2P17706 415 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 KCNC4Q03721 635 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 SPIRE1Q08AE8 756 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 FSTL4Q6MZW2 842 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 C11orf74Q86VG3 221 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 DAGLBQ8NCG7 672 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 CNNM3Q8NE01 707 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 RABGGTAQ92696 567 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 CHFRQ96EP1 664 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PAAF1Q9BRP4 392 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 FAM86B1E9PN63 330 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 ZNF197O14709 1029 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 KIF4AO95239 1232 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 APBB3O95704 486 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PSAPP07602 524 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 FAM86B2P0C5J1 330 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 MX1P20591 662 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 GBP1P32455 592 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 OR1D2P34982 312 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 SREBF1P36956 1147 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 UGCGQ16739 394 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 TMEM196Q5HYL7 178 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 FAM171A1Q5VUB5 890 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 SLC23A3Q6PIS1 610 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 TICAM2Q86XR7 235 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PNPLA1Q8N8W4 532 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 FAM200AQ8TCP9 573 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 E2F7Q96AV8 911 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PGBD1Q96JS3 809 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 CORO1BQ9BR76 489 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 CNNM2Q9H8M5 875 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 SNTG2Q9NY99 539 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 OGFRQ9NZT2 677 aa12.97□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 CAPN9O14815 690 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 WISP1O95388 367 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 BRD2P25440 801 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 SMARCA1P28370 1054 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 EPHA5P54756 1037 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 GRIK3Q13003 919 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 CAMK2BQ13554 666 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 KSR1Q8IVT5 923 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 TTC8Q8TAM2 541 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 HASPINQ8TF76 798 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 PIGKQ92643 395 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 TMEM209Q96SK2 561 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 ANO3Q9BYT9 981 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 TMEM74BQ9NUR3 256 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 HES2Q9Y543 173 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 TSC2P49815 1807 aa12.96□□□□□ -0.33
HCG18-241ENST00000602290 ABCA12Q86UK0 2595 aa12.96□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 THADAQ6YHU6 1953 aa12.96□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 RNF40O75150 1001 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 TADA2AO75478 443 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 ITPKBP27987 946 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 CYP4F3Q08477 520 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 CEP57Q86XR8 500 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 RHPN2Q8IUC4 686 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 CRYGNQ8WXF5 182 aa12.95□□□□□ -0.34
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD7Q92527 254 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms