RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 RFX1P22670 979 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 PAX3P23760 479 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 RFC2P35250 354 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 RAB27AP51159 221 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 CLCN3P51790 818 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 GSDMDP57764 484 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 RBL2Q08999 1139 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 MAN2A1Q16706 1144 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.96□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.96□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.96□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.96□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.96□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 A0A0B4J269 797 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PQC6 194 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM150BA6NC51 233 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 CCDC172P0C7W6 258 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 COL6A1P12109 1028 aa7.95□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 GPD1LQ8N335 351 aa7.95□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 FBXL18Q96ME1 805 aa7.95□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.95□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.95□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.95□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.95□□□□□ -1.14
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SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GUA9 196 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 LGALS16A8MUM7 142 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 TGFB1I1O43294 461 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 GPR32O75388 356 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 RPS6KA5O75582 802 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 PFKMP08237 780 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 THPOP40225 353 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 MAP2K3P46734 347 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 CDK7P50613 346 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 CASP5P51878 434 aa7.94□□□□□ -1.14
SMAD4-210ENST00000590061 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.94□□□□□ -1.14
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