RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 ACLYP53396 1101 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NOP14P78316 857 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 MGAT3Q09327 533 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 UBR7Q8N806 425 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 L2HGDHQ9H9P8 463 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 M0QZ92 97 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NFICP08651 508 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFAIP3P21580 790 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 JADE1Q6IE81 842 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35F6Q8N357 371 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CXorf38Q8TB03 319 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.511e-21■■■■■ 79.2
CAPNS1-207ENST00000589146 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP26A1O43174 497 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SGPL1O95470 568 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 MYL6P60660 151 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPC3Q13507 836 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGA7Q13683 1181 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 UBXN11Q5T124 520 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SIX4Q9UIU6 781 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CHRNB2P17787 502 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 BPIFB4P59827 614 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 PTK7Q13308 1070 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM228AQ86W67 206 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT8BQ93098 351 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-207ENST00000589146 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CHRNA1P02708 482 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 H2AFZP0C0S5 128 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP11B1P15538 503 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ATICP31939 592 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 USP8P40818 1118 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PTGISQ16647 500 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM26DQ5JW98 314 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 H2AFVQ71UI9 128 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF677Q86XU0 584 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX27Q96L92 541 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 NIF3L1Q9GZT8 377 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM17Q9Y577 477 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CITO14578 2027 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CDR2Q01850 454 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBB2AQ13885 445 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 XKR4Q5GH76 650 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ARID3AQ99856 593 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CHST12Q9NRB3 414 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SNTG2Q9NY99 539 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CTAGE9A4FU28 777 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CAND2O75155 1236 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TACC1O75410 805 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 GZMAP12544 262 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF132P52740 706 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB6Q15916 424 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF699Q32M78 642 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM58Q8NG06 486 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms